Protein–RNA interactions for Protein: Q12791

KCNMA1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,236 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMA1Q12791 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.03
KCNMA1Q12791 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
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KCNMA1Q12791 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 FENDRR-203ENST00000595886 3095 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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KCNMA1Q12791 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
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KCNMA1Q12791 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
KCNMA1Q12791 HRASLS-201ENST00000264735 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
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