Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FN3K-201ENST00000300784 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ACAT1-201ENST00000265838 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
SYCNQ0VAF6 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
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