Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 KIAA0895L-206ENST00000563902 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CCDC15Q0P6D6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms