Protein–RNA interactions for Protein: Q09470

KCNA1, Potassium voltage-gated channel subfamily A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNA1Q09470 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
KCNA1Q09470 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
KCNA1Q09470 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms