Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ELAC1-204ENST00000591429 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 EARS2-206ENST00000563232 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RHBDD3-201ENST00000216085 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
RBBP4Q09028 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RBBP4Q09028 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms