Protein–RNA interactions for Protein: Q08493

PDE4C, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4C, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4CQ08493 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
PDE4CQ08493 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CDHR1-201ENST00000332904 2694 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TMEM11-201ENST00000317635 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 OR10C1-204ENST00000622521 1039 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 LCORL-201ENST00000326877 5604 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 IL34-204ENST00000566361 1001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
PDE4CQ08493 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms