Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.29■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC32.26■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.76
GOLGA3Q08378 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 EFHD1-201ENST00000264059 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 VEGFA-204ENST00000372064 2909 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC32.22■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
GOLGA3Q08378 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms