Protein–RNA interactions for Protein: Q08209

PPP3CA, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, humanhuman

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP3CAQ08209 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
PPP3CAQ08209 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PPP3CAQ08209 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66.3 ms