Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SMIM10L2B-201ENST00000433425 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TGM3Q08188 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CFL1-211ENST00000531407 1062 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TPST2-202ENST00000398110 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 RIOX2-201ENST00000333396 5347 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 ME2-202ENST00000382927 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TGM3Q08188 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.3 ms