Protein–RNA interactions for Protein: Q07837

SLC3A1, Neutral and basic amino acid transport protein rBAT, humanhuman

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC3A1Q07837 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 NAA20-201ENST00000310450 920 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
SLC3A1Q07837 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 CEACAM4-201ENST00000221954 1205 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
SLC3A1Q07837 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms