Protein–RNA interactions for Protein: Q07065

CKAP4, Cytoskeleton-associated protein 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP4Q07065 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ACD-202ENST00000393919 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
CKAP4Q07065 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 ABHD1-207ENST00000621324 1078 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
CKAP4Q07065 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms