Protein–RNA interactions for Protein: Q06945

SOX4, Transcription factor SOX-4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX4Q06945 AL391422.3-201ENST00000603791 2761 ntBASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
SOX4Q06945 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.27■■□□□ 1
SOX4Q06945 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 KIAA1456-201ENST00000400069 1982 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 CD177P1-201ENST00000606252 935 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
SOX4Q06945 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms