Protein–RNA interactions for Protein: Q06828

FMOD, Fibromodulin, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMODQ06828 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
FMODQ06828 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FMODQ06828 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.42
FMODQ06828 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 KCNQ5-207ENST00000403813 6539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
FMODQ06828 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
FMODQ06828 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms