Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 ACYP1-205ENST00000555463 789 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
GABPB1Q06547 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 UBQLN4-201ENST00000368309 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 GOLGA2P7-201ENST00000316967 2525 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 DCBLD2-201ENST00000326840 6122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
GABPB1Q06547 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms