Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AL035696.2-201ENST00000407941 709 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 EMC4-208ENST00000559078 599 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC005899.5-201ENST00000584721 552 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 REXO1L10P-201ENST00000615707 1290 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TNP2Q05952 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TNP2Q05952 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TNP2Q05952 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TNP2Q05952 AP001059.1-201ENST00000442785 523 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TNP2Q05952 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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TNP2Q05952 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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TNP2Q05952 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 C7orf26-201ENST00000344417 2182 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC13.23□□□□□ -0.29
TNP2Q05952 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
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