Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
UBXN1Q04323 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MRPL39-201ENST00000307301 1199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MRPL39-202ENST00000352957 1110 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 Z92544.1-201ENST00000567091 730 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 DUT-201ENST00000331200 2147 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
UBXN1Q04323 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.9 ms