Protein–RNA interactions for Protein: Q01959

SLC6A3, Sodium-dependent dopamine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A3Q01959 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
SLC6A3Q01959 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 B4GALT5-201ENST00000371711 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
SLC6A3Q01959 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms