Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ANKDD1B-204ENST00000601380 2569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CBR1-205ENST00000530908 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 DPP10-203ENST00000393147 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SPIBQ01892 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms