Protein–RNA interactions for Protein: Q01850

CDR2, Cerebellar degeneration-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDR2Q01850 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CDR2Q01850 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 FAM110A-204ENST00000381941 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CDR2Q01850 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms