Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CDC42EP1Q00587 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 FOSL1-204ENST00000532401 1132 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TNFRSF12A-206ENST00000575124 1133 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NUDT16P1-203ENST00000513809 620 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CDC42EP1Q00587 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms