Protein–RNA interactions for Protein: Q00056

HOXA4, Homeobox protein Hox-A4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA4Q00056 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HOXA4Q00056 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 AC073316.3-201ENST00000437354 982 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 ZDHHC20-204ENST00000415724 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 AC005829.2-201ENST00000571422 1056 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
HOXA4Q00056 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms