Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FGD1P98174 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 BCAM-201ENST00000270233 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
FGD1P98174 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
FGD1P98174 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
FGD1P98174 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 CXXC5-201ENST00000302517 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
FGD1P98174 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
FGD1P98174 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
FGD1P98174 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms