Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ZDHHC16-202ENST00000352634 1718 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 NFIL3-201ENST00000297689 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 LMLN-204ENST00000420910 2423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
FAM3AP98173 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
FAM3AP98173 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
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