Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 PLAGL1-207ENST00000417959 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TSTA3-201ENST00000425753 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 AL591742.1-201ENST00000604433 565 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 EMC7-201ENST00000256545 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UBE2HP62256 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UBE2HP62256 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms