Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TTYH1-202ENST00000376530 1885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SLC25A1P2-201ENST00000430693 912 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 C1QTNF8-202ENST00000621771 897 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
ERVK-21P61565 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-21P61565 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-21P61565 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-21P61565 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-21P61565 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-21P61565 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
ERVK-21P61565 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms