Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC080023.1-201ENST00000526906 803 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FLCN-203ENST00000389169 1692 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
ERVS71-1P61550 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms