Protein–RNA interactions for Protein: P61204

ARF3, ADP-ribosylation factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF3P61204 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARF3P61204 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARF3P61204 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARF3P61204 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARF3P61204 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ARF3P61204 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 CLTA-202ENST00000345519 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ARF3P61204 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 AC068987.1-201ENST00000562996 427 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ARF3P61204 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARF3P61204 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARF3P61204 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARF3P61204 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARF3P61204 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARF3P61204 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARF3P61204 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ARF3P61204 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms