Protein–RNA interactions for Protein: P57059

SIK1, Serine/threonine-protein kinase SIK1, humanhuman

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIK1P57059 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 ZFP69B-202ENST00000411995 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
SIK1P57059 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
SIK1P57059 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 BSCL2-207ENST00000407022 1516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIK1P57059 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIK1P57059 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 KLHDC4-204ENST00000353170 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIK1P57059 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIK1P57059 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms