Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
NRG3P56975 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 FAM201B-201ENST00000458407 597 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 KIRREL2-202ENST00000347900 2015 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 TMPRSS5-212ENST00000545579 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
NRG3P56975 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
NRG3P56975 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms