Protein–RNA interactions for Protein: P55854

SUMO3, Small ubiquitin-related modifier 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 103 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUMO3P55854 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ACOT2-205ENST00000622407 1604 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 IRX4-208ENST00000622814 2398 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PAIP1-203ENST00000436644 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TSPAN14-209ENST00000481124 808 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 PRR7-202ENST00000502922 1345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUMO3P55854 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms