Protein–RNA interactions for Protein: P55291

CDH15, Cadherin-15, humanhuman

Predictions only

Length 814 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH15P55291 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH15P55291 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH15P55291 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
CDH15P55291 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 RNF167-205ENST00000571816 1728 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
CDH15P55291 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 XPA-201ENST00000375128 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
CDH15P55291 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
CDH15P55291 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms