Protein–RNA interactions for Protein: P55210

CASP7, Caspase-7, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP7P55210 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CASP7P55210 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CASP7P55210 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CASP7P55210 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 MRPL36-202ENST00000505059 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CASP7P55210 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CASP7P55210 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 ADCYAP1-202ENST00000450565 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CASP7P55210 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP7P55210 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP7P55210 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP7P55210 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP7P55210 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP7P55210 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP7P55210 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP7P55210 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
CASP7P55210 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP7P55210 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP7P55210 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP7P55210 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP7P55210 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP7P55210 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
CASP7P55210 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
CASP7P55210 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms