Protein–RNA interactions for Protein: P55196

AFDN, Afadin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,824 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFDNP55196 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AFDNP55196 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ACTR8-202ENST00000482349 2091 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DMAP1-202ENST00000361745 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AFDNP55196 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AFDNP55196 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AFDNP55196 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TESC-AS1-201ENST00000547006 1053 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
AFDNP55196 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
AFDNP55196 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
AFDNP55196 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms