Protein–RNA interactions for Protein: P55040

GEM, GTP-binding protein GEM, humanhuman

Predictions only

Length 296 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEMP55040 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEMP55040 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GEMP55040 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GEMP55040 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GEMP55040 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 METTL21A-207ENST00000442521 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GEMP55040 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
GEMP55040 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
GEMP55040 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms