Protein–RNA interactions for Protein: P52744

ZNF138, Zinc finger protein 138, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF138P52744 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 INTS11-205ENST00000429572 1104 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 LYNX1-204ENST00000614491 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ZNF138P52744 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 ABCC6P2-202ENST00000542005 706 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 ABCC6-204ENST00000575728 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 GAS2L1-210ENST00000621062 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ZNF138P52744 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ZNF138P52744 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ZNF138P52744 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms