Protein–RNA interactions for Protein: P52198

RND2, Rho-related GTP-binding protein RhoN, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RND2P52198 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
RND2P52198 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RND2P52198 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 AC069431.1-201ENST00000488882 1877 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 PLSCR3-213ENST00000576362 1605 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 ABHD5-205ENST00000458276 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RND2P52198 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RND2P52198 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RND2P52198 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RND2P52198 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms