Protein–RNA interactions for Protein: P51878

CASP5, Caspase-5, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP5P51878 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 AC009237.14-201ENST00000609975 1594 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 GGTLC1-203ENST00000335694 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CASP5P51878 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CASP5P51878 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP5P51878 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP5P51878 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP5P51878 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP5P51878 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CASP5P51878 PNMA2-204ENST00000522362 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 NEU4-201ENST00000325935 2288 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 IGFALS-201ENST00000215539 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CASP5P51878 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CASP5P51878 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.3 ms