Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC3P51654 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
GPC3P51654 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC092720.2-201ENST00000602388 1665 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 PRKG2-207ENST00000628926 2623 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC3P51654 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC3P51654 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
GPC3P51654 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms