Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ERFP50548 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 RNF32-208ENST00000432459 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ERFP50548 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 FXYD6-211ENST00000539526 2132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ERFP50548 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 ACBD4-203ENST00000398322 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ERFP50548 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ERFP50548 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 TMCO3-201ENST00000375391 2132 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ERFP50548 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERFP50548 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERFP50548 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ERFP50548 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERFP50548 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ERFP50548 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms