Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 DND1-201ENST00000542735 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
TTPAP49638 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 PRDM11-201ENST00000424263 1858 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
TTPAP49638 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 TPD52L1-207ENST00000527711 999 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RGMA-211ENST00000557420 989 ntTSL 3 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
TTPAP49638 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
TTPAP49638 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 CHP2-201ENST00000300113 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AGTR1-209ENST00000497524 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
TTPAP49638 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
TTPAP49638 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
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