Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.78
FNTBP49356 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 LGALS12-203ENST00000394618 1618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
FNTBP49356 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
FNTBP49356 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
FNTBP49356 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.4 ms