Protein–RNA interactions for Protein: P48382

RFX5, DNA-binding protein RFX5, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX5P48382 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX5P48382 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX5P48382 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX5P48382 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX5P48382 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX5P48382 PNCK-201ENST00000340888 1508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
RFX5P48382 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 CCAR2-214ENST00000613179 1421 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
RFX5P48382 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
RFX5P48382 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
RFX5P48382 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
RFX5P48382 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
RFX5P48382 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
RFX5P48382 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
RFX5P48382 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms