Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PTPA-216ENST00000432651 857 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CYP2D6-201ENST00000359033 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TM4SF4P48230 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC116351.2-201ENST00000606540 1585 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AP003501.2-201ENST00000524433 477 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TM4SF4P48230 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms