Protein–RNA interactions for Protein: P43007

SLC1A4, Neutral amino acid transporter A, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC1A4P43007 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SBF2-AS1-202ENST00000499953 854 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SUMO3-201ENST00000332859 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC1A4P43007 Z83844.2-201ENST00000456099 1945 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms