Protein–RNA interactions for Protein: P42702

LIFR, Leukemia inhibitory factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,097 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIFRP42702 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIFRP42702 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 H3F3A-204ENST00000366816 799 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 GTF2IRD2B-210ENST00000629105 1910 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIFRP42702 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ARNTL2-204ENST00000395901 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIFRP42702 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIFRP42702 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LIFRP42702 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIFRP42702 TADA2B-204ENST00000512388 1343 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIFRP42702 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIFRP42702 CASP6-201ENST00000265164 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIFRP42702 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIFRP42702 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIFRP42702 KCNN2-207ENST00000610748 2091 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 DEDD2-205ENST00000596251 1183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 INTS11-209ENST00000450926 1839 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIFRP42702 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIFRP42702 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIFRP42702 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms