Protein–RNA interactions for Protein: P40198

CEACAM3, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 252 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEACAM3P40198 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 KCNE5-201ENST00000372101 1473 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 GOLGA2P11-201ENST00000562660 1621 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 MT3-201ENST00000200691 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AC008667.2-201ENST00000504413 469 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 B4GALNT1-213ENST00000552350 1649 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CEACAM3P40198 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms