Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
NUP62P37198 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 ZSCAN18-201ENST00000240727 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
NUP62P37198 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
NUP62P37198 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP62P37198 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP62P37198 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP62P37198 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP62P37198 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP62P37198 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP62P37198 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 KMT5A-202ENST00000402868 3140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PPP5C-202ENST00000391919 1929 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
NUP62P37198 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 JMJD1C-202ENST00000399262 8666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ST3GAL4-204ENST00000444328 1812 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
NUP62P37198 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms