Protein–RNA interactions for Protein: P36544

CHRNA7, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-7, humanhuman

Predictions only

Length 502 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA7P36544 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 P4HB-201ENST00000331483 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TP53RK-201ENST00000372102 2012 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DLEU7-201ENST00000400393 2092 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 BCKDK-202ENST00000287507 1907 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
CHRNA7P36544 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms