Protein–RNA interactions for Protein: P36542

ATP5C1, ATP synthase subunit gamma, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5C1P36542 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 C5orf17-202ENST00000512559 1984 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 GPAA1-201ENST00000355091 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 TEAD1-206ENST00000527636 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AKR7A3-201ENST00000361640 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 NAE1-201ENST00000290810 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CACNB2-203ENST00000352115 1911 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MED26-207ENST00000611692 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 BCKDK-203ENST00000394950 1997 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
ATP5C1P36542 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RLBP1-201ENST00000268125 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 KCNS3-201ENST00000304101 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 AL512408.1-201ENST00000569378 2000 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5C1P36542 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms