Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

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Length 343 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC007383.3-201ENST00000453039 1411 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC009093.4-201ENST00000567984 561 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 PFKFB3-217ENST00000626882 1965 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ADAD1-202ENST00000388724 1912 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AL929601.1-201ENST00000551565 573 ntTSL 4 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC104581.1-201ENST00000324348 2852 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
HOXD13P35453 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 OGG1-209ENST00000383826 1069 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
HOXD13P35453 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
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